【Pandas】PickleファイルからDataFrameを作る

Pandas
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こんにちは、JS2IIUです。

時系列データなど、大量のデータを取り扱う場合にPickleファイルを一時保存する場合があります。このPickleファイルを簡単に活用したい、という方に向けて、サッとDataFrameに読み込む方法を説明します。

今回もよろしくお願いします。

import pickle
df = pickle.load(pickle_file)

はじめに

Pickleは、Pythonオブジェクトをバイナリ形式で保存するための標準的な方法です。PandasのDataFrameもPickleを使って保存することができます。Pickle形式は、Pythonオブジェクトをそのまま保存できるため、データの保存と読み込みが高速で便利です。

1. Pickleファイルとは?

Pickleは、Pythonのオブジェクトをバイナリ形式で保存するためのモジュールです。これを使用することで、リスト、辞書、クラスなど、Pythonで扱えるほぼすべてのオブジェクトをファイルに保存し、後でそのまま復元することができます。Pickleは、主に以下のような場面で使用されます:

  • モデルや大規模なデータセットを保存する
  • データの一時的な保存と読み込みを簡単に行いたい

PickleはPython特有の形式であり、他のプログラミング言語との互換性はありません。そのため、他の言語で利用する際には別の形式に変換する必要があります。

2. PickleファイルからDataFrameを作成する方法

まずは、PandasのDataFrameをPickle形式で保存し、それを読み込んで新たにDataFrameを作成するサンプルコードを紹介します。以下では、欠損値のないデータを使っています。

import pandas as pd
import pickle

# DataFrameの作成
data = [
    {'name': 'Yamada', 'age': 28, 'department': 'Sales'},
    {'name': 'Sato', 'age': 34, 'department': 'HR'},
    {'name': 'Suzuki', 'age': 29, 'department': 'Engineering'}
]

df = pd.DataFrame(data)

# DataFrameをPickle形式で保存
pickle_file_path = 'employee_data.pkl'
with open(pickle_file_path, 'wb') as file:
    pickle.dump(df, file)

# PickleファイルからDataFrameを読み込む
with open(pickle_file_path, 'rb') as file:
    df_loaded = pickle.load(file)

# 結果の表示
print(df_loaded)

出力結果:

      name  age   department
0   Yamada   28      Sales
1     Sato   34         HR
2   Suzuki   29  Engineering

このコードでは、まずリスト型のデータをPandasのDataFrameに変換し、そのDataFrameをPickle形式で保存します。次に、そのPickleファイルを読み込んでDataFrameを復元し、元のデータが保持されていることを確認しています。

3. Pickle形式の特徴と注意点

  • バイナリ形式: Pickleはバイナリ形式でデータを保存します。テキストファイルと違い、Pickleファイルは人間が直接読める形式ではありません。
  • 互換性: PickleはPython専用の形式であり、他のプログラミング言語と互換性はありません。そのため、異なる言語でデータを利用する場合は、別のデータ形式(CSV、JSONなど)に変換する必要があります。
  • セキュリティの注意: 不正なPickleファイルを読み込むと、悪意のあるコードが実行される可能性があります。信頼できないソースからのPickleファイルの読み込みは避けるべきです。

Pickleファイルは非常に便利で高速ですが、そのセキュリティリスクにも注意が必要です。

4. まとめ

Pandasを使用すると、簡単にDataFrameをPickle形式で保存し、後で読み込むことができます。Pickle形式はPython専用のバイナリ形式であり、高速でデータを保存・読み込むことができるため、特に大規模なデータの保存に適しています。しかし、セキュリティの観点から、信頼できるソースからのPickleファイルのみを読み込むようにしましょう。

参考リンク

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Pandasについて詳しく知りたいかた、もっと使いこなしたい方におすすめの本です。数年前に購入しましたが、今も手元に置いて時々見返しています。

「pandasクックブック Pythonによるデータ処理のレシピ」Theodore Petrou著、黒川利明訳。

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